配方奶粉和普通奶粉的区别在于成分不同。为了使奶粉的含量更接近母乳的成分，改变了配方奶粉中酪蛋白、饱和脂肪酸、不饱和脂肪酸、乳糖和矿物质的含量，将蛋白质分解成更小的因子，使其适合各种特殊体质的宝宝。而普通奶粉中的乳蛋白分子都是完整的，没有经过任何修饰，适合普通宝宝食用。

成分不同也有一定影响。配方奶粉中添加了更多独特的微量元素，更有针对性的针对不同体质需求的宝宝，比如容易腹泻、容易溢奶的宝宝，或者对牛初乳过敏的宝宝。普通奶粉富含蛋白质、氨基酸、维生素、矿物质等，营养均衡全面，适合普通宝宝食用。