受孕方式：自然受孕是夫妻通过性交的方式精卵结合怀孕，而试管婴儿则是将女性的卵子取出与男方精子体外受精形成胚胎后再移植到女性的子宫内；

身体素质：自然怀孕受精有一定的随机性，而试管婴儿可以对形成的胚胎进行筛选，挑选优质胚胎移植，因此某种意义上来看试管宝宝体质会更好一些；

智商方面：自然怀孕的宝宝和试管婴儿除了受孕场所不同外，其他流程基本上是一致的，并不会对宝宝产生影响，因此智商方面是没有区别的；

寿命长短：无论是自然受孕还是试管婴儿的健康程度都差不多的，影响寿命的因素有很多，与受孕方式无关，因此网上所说“试管婴儿寿命短”是没有任何依据的。

试管婴儿体外受精-联合胚胎移植技术（IVF-ET）简称试管婴儿，或卵浆内单精子注射（ICSI）方法，对无法自然受孕的患者作为辅助生育的手段无疑是一种进步和希望，但存在一定的缺陷。

正常的女性每个月经周期只排出一个卵子，进行试管婴儿手术时，为了提高手术的成功率，通常会进行促排卵治疗，排出多个卵子，进行胚胎培养。但是做试管婴儿用的促排卵激素容易造成母体激素紊乱，可能导致提前绝经，卵巢早衰等情况，通俗来讲就是造成女性过早衰老，并且患上卵巢、乳腺、子宫癌等癌症的可能性大大提升。

而且如患者输卵管未完全堵塞，移植入宫腔胚胎可能流入输卵管内发生宫外孕，有时甚至发生宫内合并宫外妊娠，应予以高度重视，及早诊治，以免发生大出血等危险。任何自然妊娠中发生的胎儿畸形均可发生在“试管婴儿”中。

另外如果女性身体不具备孕育条件，比如内分泌紊乱，黄体功能不全，有过流产史。即使施行试管婴儿手术成功，也可能造成流产。

增加了多胎妊娠风险，对女性生理的干扰较大。刺激排卵导致卵巢反应低下，易出现于卵巢功能早衰，年轻女性于40岁以前闭经、卵巢不敏感综合征，成人呼吸窘迫综合征等等。